El templo que hoy conocemos sucede al construido en 1515 en estilo Gótico que a su vez sucedería al Románico destruido por un incendio en 1434 y a la primitiva capilla mozárabe. Está levantado a partir de 1681 sobre planos de Felipe Sánchez y Herrera “el Mozo”, además de las posteriores intervenciones de Ventura Rodríguez a quien corresponden la Santa Capilla, la sucesión de cúpulas y las torres terminadas a mediados del siglo XX. Se trata pues de un impresionante edificio en cuyo interior podemos contemplar el Retablo Renacentista de Damián Forment o el fresco de la Cúpula Regina Martyrum de Goya, obras que configuran un espacio magnifico para la tradición y devoción a la Virgen del Pilar.